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生物網的問題,我們搜遍了碩博士論文和台灣出版的書籍,推薦EmeranMayer寫的 腸道.腸道菌與人體免疫:餵飽你的腸道菌,就能提高免疫力改善身心健康 和陳增強,雷輝,史永堂的 網路科學中的度量分析與應用都 可以從中找到所需的評價。

這兩本書分別來自如果出版社 和崧燁文化所出版 。

國立高雄科技大學 資訊工程系 鐘文鈺所指導 孫維鍇的 在圖神經網路中加入負分連結後對於分群效果的影響 (2021),提出生物網關鍵因素是什麼,來自於圖神經網路、K-means、基因共表達關聯網路。

而第二篇論文國立中正大學 化學工程研究所 王逢盛所指導 朱思維的 基於約束的SARS-COV-2建模識別低副作用的抗病毒靶點:以心肌細胞感染為例 (2021),提出因為有 新冠病毒、抗病毒基因、抗病毒代謝物的重點而找出了 生物網的解答。

接下來讓我們看這些論文和書籍都說些什麼吧:

除了生物網,大家也想知道這些:

腸道.腸道菌與人體免疫:餵飽你的腸道菌,就能提高免疫力改善身心健康

為了解決生物網的問題,作者EmeranMayer 這樣論述:

疫苗無法遏止疾病,但腸道菌能   衰弱的腸道會使我們更容易染疫,並增加重症的風險 健康的腸道菌相是解決21世紀所有健康危機的唯一解方     《腸道•大腦•腸道菌》暢銷作者以網絡科學的概念,   再次解說「腸腦菌軸」的最新研究成果     附:餵養腸道菌食譜     為什麼罹患慢性病的covid-19確診者的死亡率較高?   為什麼憂鬱症、神經退化疾病,甚至二型糖尿病患者各自都有類似的腸道菌相?   腸道菌能如何幫助我們面對當前的重大健康危機?     •腸道與腸道菌失去協調是現代人不健康的主因   現代社會的食物已大大改變我們腸道菌的樣貌,許多肩負人體重要功能的菌株因缺乏需要的食物已不復

存在,或改而以人體組織為食物,例如膳食纖維不足時,腸道菌會把腸道壁的黏液當作食物,使得我們的腸壁變薄,腸道通透性增加,引起慢性發炎,成為各種慢性病的根本原因,並一旦遇到嚴重的流行性疾病,導致中重症的機率就會大增。     •不同的腸道菌各有不同的核心功能,多樣且豐富的腸道菌是健康的關鍵   沒有腸道菌的參與,人體需要的荷爾蒙、神經傳導素、細胞激素等訊息傳遞分子都會不足。不同的腸道菌在這裡扮演不同的角色,雖然世界各地都有重要的研究單位對此展開研究,但我們對此的理解仍然相當初步。既然我們不知道哪一種腸道菌負擔哪一種功能,讓腸道菌豐富而多樣,就是最好的方案。     •不只飲食會影響腸道菌,壓力、睡

眠和運動也會   人體從來不是線性的,網絡科學運用到人體上,也影響了我們對腸腦菌軸的理解。慢性壓力會影響腸道菌的基因活動,增加細菌與腸道免疫系統的接觸。運動會讓腸道菌組成產生變化,適度運動有益腸道菌相,但極限運動則會增加腸道通透性,讓身體發炎,讓你的身體一直處在免疫危機中。正念、冥想、正常的晝夜節律都必須加入我們維持健康腸道菌相的必須條件中。     •提升免疫力,不是靠吃益生菌,而是餵飽你的腸道菌   我們習慣吃益生菌保健,以為只要補充某些菌種,達到某種固定的腸道菌相,一切健康問題都能解決。但我們不知道的是,其實腸道菌隨著每天的時間節律、季節轉換、居住地點、所吃的食物一直在變動。我們不知道最

適合的腸道菌相是什麼,因此靠補充益生菌來達到目標是非常不精準也不一定有效的方式。     •以餵養腸道菌為目標的全新飲食方式   餵養腸道菌,提供腸道菌食物讓腸道菌豐富多元,自然達到最適合身體需求的健康平衡才是提升免疫力並讓身心健康的解答。培養豐富的腸道菌相需要多元的「腸道菌可利用碳水化合物」(MACs),書中提供了以餵養腸道菌為目標的食譜,並告訴我們怎樣的環境和生活方式對餵養我們體內的腸道菌最有助益。   本書特色     •以網絡科學的概念,進一步說明腸腦菌軸運作的方式   •從腸道菌與免疫力的關連,告訴我們健康的腸道菌相為什麼能提升免疫力   •結合飲食、壓力、睡眠、運動四大方向的腸道菌

健康指南   •以增加腸道菌可利用碳水化合物為目標的餵養腸道菌食譜   專業推薦     吳偉愷醫師(台大醫院肝膽腸胃科主治醫師)   張立人醫師(《大腦營養學全書》暨《皮膚營養學全書》作者)   劉博仁醫師/博士(台中市科博特診所院長)   (按筆劃順序排列)   專家推薦     •「邁爾醫師不僅會讓您了解居住在我們腸道中的各種微生物的重要性,還會讓您更廣泛地了解支持生物多樣性的食物選擇如何拯救生命、保護我們免受新感染和保護地球。令人著迷的是,改善我們個人健康的選擇如何與保護和創造肥沃土壤、清潔的水,以及我們的母艦——地球和我們的後代相關聯。」——喬·富爾曼 (Joel Fuhrman),

《傅爾曼醫生教你真正吃出健康》暢銷書作者     •「一本將腸道健康、人類健康和生態健康作為主題的書。一位醫生、作家和思想家的啟示性讀物,我們都需要聽到,現在比以往任何時候都多。」丹·巴伯(Dan Barber),紐約時報暢銷書《第三盤》作者,米其林2星餐廳主廚

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在圖神經網路中加入負分連結後對於分群效果的影響

為了解決生物網的問題,作者孫維鍇 這樣論述:

圖神經網路是近期在深度學習領域中一個熱門的方向。我們希望能夠運用此架構來分析生物的共表達基因關聯網路,以瞭解基因的功能、作用與變化。目前文獻所提出的方法裡,輸入資料為圖形中點和點的連接關係(0 or 1)或是權重(weight >= 0);但是生物網路有複雜的相互關聯性,只有0,1或weight可能無法完整描述。因此我們在此篇論文中加入負分關聯值,以代表抑制作用的關聯性,希望能夠改進共表達基因關聯網路中點分群的精準度。本文提出SignGraphSAGE方法來取代GraphSAGE中建議的Aggregation function,共有SubAGG、Sign及SignSubAGG 三項公式,其中

SubAGG只考慮正相關,Sign及SignSubAGG有加入負相關做計算。本文所使用的資料集包括人造資料集Karate club(大學空手道俱樂部的社交網絡)、PyTorch Geometric資料集中選出的Cora、Amazon資料集;以及鰻魚的嗅覺與視覺基因表達值。資料的處理上,先計算任意兩個節點特徵之間的相關係數,以閾值來決定連接關係。將連接關係所形成的網路圖帶入SubAGG、Sign及SignSubAGG進行特徵更新,最後將更新好的特徵以K-means分群。本文希望藉由考量了負相關的資訊能夠幫助圖神經網路來做分群,以了解資料間的相似度。

網路科學中的度量分析與應用

為了解決生物網的問題,作者陳增強,雷輝,史永堂 這樣論述:

  本書共分10章,第1章介紹了網路相關的基本概念以及常見的複雜網路模型。第2章敘述了進行複雜網路研究所需的圖論領域的基礎知識。第3章介紹了與距離相關的一些度量。第4章提出了一些爲研究網路的聚類和圈結構而建立的度量。第5章主要研究了網路的度分佈及相關關係。第6章介紹了網路熵的相關內容。第7章利用特徵譜研究了網路的一些特性。第8章介紹一些常見的衡量網路相似性的度量。第9章介紹了一些常見的複雜網路度量。第10章列舉了複雜網路度量的一些相關應用,包括網路度量的極值問題、網路度量在分子網路中的應用、網路度量在社會網路中的應用等。   本書不僅對從事網路科學理論的研究人員有重要參考

價值,而且能爲從事智慧物聯網、智慧電網、智慧交通網以及智慧製造領域的工程技術人員提供很好的理論指導與幫助。

基於約束的SARS-COV-2建模識別低副作用的抗病毒靶點:以心肌細胞感染為例

為了解決生物網的問題,作者朱思維 這樣論述:

自從2019年12月下旬,新型冠狀病毒引起全球關注,起初尚未有治療新冠病毒的藥物,由於COVID-19的傳播使得全球死亡率提升,造成嚴重的經濟以及社會的影響,因此,各國都在研發抗病毒藥物。本研究基於人類基因組規模代謝網絡Recon3D,搭配GEO-NCBI的基因體組學數據以最佳化反應依賴性評估建立出健康宿主心肌細胞以及受病毒感染心肌細胞模型。此外,為了更符合生物體生存條件,使用了根據DMEM以及RPMI-1640培養基做為營養成分,再使用代謝通量一致性測試分析整個模型代謝物與反應是否達平衡,目的為了在分析模型時更為準確。最後透過本實驗室開發的巢狀式混和差值進化演算法及突變通量均衡分析進行計算

,模擬病毒顆粒進入宿主細胞後與健康宿主細胞通量變化差異。本研究考慮了多目標最適化搜尋到可做為抗病毒藥物治療的基因與代謝物,結果可知,單一抗病毒基因標靶搜尋大致可以分成五類,分別是膽固醇代謝、甘油磷脂代謝、核苷酸、戊糖磷酸途徑,且發現雙標靶基因組合結果較單基因標靶效果來得好;單一抗病毒標靶代謝物大致分成四大類,分別是脂質、有機氧化合物、有機酸以及核苷酸相關的代謝物,根據病毒的代謝合成的觀點來看,這些代謝物分類是有道理的,因為病毒本身是由脂質、核苷酸以及蛋白質合成的。最後我們利用找到的標靶以及我們建立了48個HPA健康的組織模型,透過模擬代謝反應通量變化,可以得知該靶點對於其他組織的副作用程度,本

研究目標是盡可能搜尋到對每個組織副作用低的靶點。期望透過模擬找到的標靶能提供研究人員一個治療標靶的方向。