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高雄醫學大學 臨床醫學研究所博士班 郭柏麟所指導 劉冠廷的 代謝酵素在肺癌發展與免疫治療的角色探討 (2018),提出W214關鍵因素是什麼,來自於肺癌、吲、哚、胺2、3-雙加氧酶、中性球、脂質代謝、內質網壓力。

而第二篇論文國立中興大學 生命科學系所 王隆祺所指導 李賢啟的 阿拉伯芥關鍵轉錄因子EIN3蛋白質之結構與功能性分析 (2017),提出因為有 乙烯、轉錄因子、EIN3的重點而找出了 W214的解答。

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W214進入發燒排行的影片

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代謝酵素在肺癌發展與免疫治療的角色探討

為了解決W214的問題,作者劉冠廷 這樣論述:

癌症近年來都是台灣的死亡原因第一位,而其中肺癌在我國是死亡率排名第一的癌症,所以肺癌相關的致病機轉及藥物治療研究是相當重要的。Indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO)是色胺酸代謝路徑的速率決定酵素,IDO的活化會造成免疫抑制並影響腫瘤預後。之前的研究發現給予IDO shRNA可以抑制腫瘤生長並增加腫瘤中的中性球浸潤,而這些腫瘤浸潤中性球的功能還不明。研究用LLC1肺癌模式用來研究中性球的功能,以肌肉注射IDO shRNA 或口服IDO抑制劑治療可延緩腫瘤生長並增加腫瘤中的中性球,腫瘤浸潤中性球同時表現高度的tumor necrosis factor-α 和trans

forming growth factor-β。此外,IDO shRNA治療誘發脾臟中細胞的interferon-γ 和tryptophan transfer RNA 表現,系統缺乏中性球會消除IDO shRNA造成的腫瘤治療效果並抑制脾臟中細胞的interferon-γ和tumor necrosis factor-α的表現。研究認為在IDO shRNA治療後出現的腫瘤相關的中性球出現抗腫瘤的表現型態。過去研究發現部份脂質代謝酵素的表現和癌症相關。此次研究在PRECOG和Kaplan-Meier plotter 資料庫中找出 acyl-CoA thioesterase (ACOT)7、ACOT

11、ACOT13、soluble carrier family 27 member A4 (SLC27A4) 和SLC27A5 的高表現和肺癌不良臨床預後相關。內質網是細胞胞器牽涉到許多種的生理活動,在腫瘤微環境中,會造成折疊異常蛋白質的堆積,這些堆積會導致內質網壓力及未折疊蛋白質反應。增強未折疊蛋白質反應訊號路徑反應也和許多種類的癌症有關,而內質網壓力對acyl-CoA 代謝酵素的影響還未十分了解。研究在public microarray database (GEO) 取得一組資料,其中ACOT7、ACOT11、SLC27A4和SLC27A5的表現和內質網壓力無關。相反的,部分酵素的表現下

降。肺癌細胞株在經thapsigargin處置後脂肪酸吸收能力被抑制,但細胞內的活性氧化物量不受抑制,進行基因富集和調控元素分析找到可能的調控元素及肺癌在內質網壓力下反應的交互作用網路。

阿拉伯芥關鍵轉錄因子EIN3蛋白質之結構與功能性分析

為了解決W214的問題,作者李賢啟 這樣論述:

乙烯是一種調節植物生長、發育以及各種逆境反應的氣態植物賀爾蒙,主要調控花瓣凋謝、葉片老化以及果實成熟等。當乙烯與受體結合時,CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE1 (CTR1) 失去活性而無法進行ETHYLENE INSENSITIVE2 (EIN2) 的磷酸化,EIN2的C端 (C terminus) 則藉著蛋白水解作用而轉移到細胞核中使EIN3和EIL1 (EIN3-LIKE1) 蛋白結構穩定, EIN3 / EIL1所扮演的角色是在阿拉伯芥中調控眾多乙烯反應基因表達的關鍵轉錄蛋白質,而EIN3蛋白的二聚化是影響其轉錄活性的重要因素。先前的研究揭示了EIN3的核心DN

A-binding domain (DBD) (174-306 a.a.) 包含兩個鹼性結構域,BD-III (238-248 a.a.) 、BD-IV (265-274 a.a.) 以及一個富含脯氨酸的區域。BD-III及BD-IV可能直接參與了蛋白質-DNA交互作用 (protein-DNA interaction,PDI) ,而富含脯胺酸的區域則可能參與蛋白質之間的交互作用 (protein-protein interaction,PPI) 。值得注意的是,在EIN3的DBD已經發現了幾個破壞EIN3功能的突變,包括EIN3P216S,EIN3K245N,及EIN3T174A,但其對於P

PI及PDI的影響尚未被詳細的檢驗。此外,我們實驗室針對破壞EIN3二聚化篩選得到三種小分子化合物,分別命名為7922,2133,及2397。以分子對接分析預測,與此三個化合物形成共價鍵的胺基酸可能會影響EIN3二聚化的功能。我使用定點突變的方式產生P216、K245、T174及其鄰近胺基酸的置換突變,同時也包括與小分子化合物可能形成鍵結的胺基酸,接著利用酵母菌單,雙雜交系統分析EIN3蛋白質PDI與PPI的功能,以及使用短暫基因表達系統檢測報導基因活性與建構阿拉伯芥 (Arabidopsis thaliana) 轉殖株進行功能互補的實驗,分析EIN3蛋白質在植物細胞與個體的活性。藉由特定區域

的蛋白結構與小分子化合物分子對接分析結果所設計的胺基酸突變及後續鑑定,我找到幾個參與EIN3活性功能的胺基酸,導致突變後的EIN3 失去PPI或/及PDI的功能,基因轉錄活性的降低與轉殖株功能互補能力的喪失,此類胺基酸包括W214、W215、P216、G218、Q179、E180、L181、K245、Q294、E295。比較特別的發現是K245的突變雖然破壞了PDI的功能,但在大量表達的轉殖株中,此突變仍保有部分EIN3的活性。此外,本研究新的發現為G218也是具有影響EIN3功能之重要胺基酸。總結此論文研究的發現,除了文獻中已知重要的EIN3胺基酸之外,其周圍的結構也同樣具有參與調控蛋白質的

功能。本研究成果除了詳細解析EIN3蛋白質結構功能,提供更多針對EIN3轉錄活性的藥物研發方向,有助於進一步應用在蔬果花卉採收後熟處理以及保鮮期之調節,論文中所建立的小分子化合物篩選平台及研究方法同樣也適用於其它農作物中重要轉錄蛋白質的功能性分析。