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國立陽明大學 生物醫學資訊研究所 巫坤品所指導 田惟升的 裁切膜蛋白預測工具與資料庫建置 (2016),提出amg gt53價格關鍵因素是什麼,來自於膜蛋白。

而第二篇論文國立陽明大學 生理學研究所 李宗玄所指導 井立捷的 瞬時受體電位香草酸第一亞型通道在粥狀動脈硬化早期病變形成中扮演之角色 (2011),提出因為有 的重點而找出了 amg gt53價格的解答。

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段落章節

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01:00 老爹進場
01:56 保險箱介紹
08:11 環境介紹
09:20 結尾

裁切膜蛋白預測工具與資料庫建置

為了解決amg gt53價格的問題,作者田惟升 這樣論述:

Chinese Abstract隨著越來越多癌症與疾病相關的生物標記被識別之後,生物標記的開發在生物研究和醫學診斷已成為新興的領域。由於非侵入性的生物標記,在臨床上易於取得,針對非侵入性的生物標誌進行開發已成為一個新趨勢,也因此分泌蛋白生物標記的識別一直受到高度重視。已知大多數分泌蛋白會透過傳統的分泌途徑進行蛋白分泌,然而,有些細胞膜蛋白也會透過細胞外切被釋放到細胞外環境。由於研究發現,細胞膜蛋白的細胞外切現象參與了細胞各種不同的生理和疾病的調節過程,因此,被外切並釋放到細胞外的膜蛋白或許也可成為非侵入性的生物標記的來源之一。先前關於膜蛋白的研究顯示,只有大約2%或4%細胞表面分子的會有細胞

外切的現象;因此,很顯然,不是每一個膜蛋白都會通過細胞外切被釋放至細胞外。在此種情況下,去評估一個膜蛋白是否會從細胞中被釋放,以及識別出藉由外切釋放到細胞外並具有臨床應用潛力的膜蛋白標記,已經是重要不可或缺的。本篇論文研究首先開發出一個計算模型產生的分類工具ShedP,用以預測膜蛋白的細胞外切的現象。當ShedP與其他目前已存在的預測工具整合,我們建立了一個篩選的工具平台SecretePipe,能夠同時預測具有信號胜肽的非膜蛋白類型的分泌蛋白質和預測會藉由細胞外切現象而從細胞中被釋放的膜蛋白。我們的結果顯示,藉由整合了ShedP,SecretePipe預測分泌蛋白數據的結果勝過其他當前最先進的

預測工具。因為具備了預測膜蛋白細胞外切的能力,SecretePipe預測膜蛋白釋放至細胞外的預測能力比其他預測工具更好,也增強了SecretePipe在識別非侵入性的生物標記上應用的潛力。此外,在論文研究中也建構了關於細胞外切膜蛋白的資料庫SheddomeDB。藉由收集在公開文獻中已被證實具有細胞外切現象的膜蛋白,SheddomeDB可供生物研究和臨床人員研究查詢目前已知具有細胞外切現象的膜蛋白。 從445關於膜蛋白細胞外切研究文獻中,收錄了401個經過驗證會經由細胞外切而釋放至細胞外的膜蛋白,其中199膜蛋白尚未被已知的資料庫標註或驗證。 SheddomeDB試圖針對細胞外切膜蛋白提供全面性

的的資訊,包括膜蛋白外切機制調控和相關的功能或疾病。 SheddomeDB資料庫可用於幫助識別找出可作為生物標誌的細胞外切膜蛋白,並幫助了解膜蛋白細胞外切的生理和病理過程中的調控作用。因此,當越來越多膜蛋白被發現藉由細胞外切的方式被釋放至細胞外,並且越來越多的研究揭示膜蛋白細胞外切參與各種過程和病理調節的作用,去識別因細胞外切而釋放的膜蛋白已成為非侵入性生物標記開發和sheddome蛋白質體學領域重要不可或缺的。為了幫助在膜蛋白細胞外切的研究並提供細胞生物學家和臨床研究人員提供了有用的資料庫資源,在本篇的論文研究提供了兩個生物資訊學的專案工具。首先,整合細胞外切預測工具ShedP的平台Secr

etePipe有助於評估一個未知的或未記錄膜蛋白被切割並從細胞釋放的可能性。接著,SheddomeDB資料庫整理出目前已知存在經過實驗驗證的細胞外切膜蛋白。這兩種設計研究已可公開並利用以下的網址使用查詢 http://bal.ym.edu.tw/SecretePipe/ 以及http://bal.ym.edu.tw/SheddomeDB/.

瞬時受體電位香草酸第一亞型通道在粥狀動脈硬化早期病變形成中扮演之角色

為了解決amg gt53價格的問題,作者井立捷 這樣論述:

粥狀動脈硬化是最常見的心血管疾病之一,其病灶形成的初期主要包含了血管內皮功能異常及泡沫細胞形成等症狀。而目前已知血管內皮功能異常是肇因於血管內皮細胞一氧化氮生成酶所產生的一氧化氮的生物利用率降低,泡沫細胞的形成則是巨噬細胞過度的吞噬修飾態的低密度脂蛋白而使得胞內膽固醇大量堆積所致。瞬時受體電位香草酸第一亞型通道被歸類為非選擇性的鈣離子通道,其活性會受到許多不同的刺激而改變,包括辣椒素、吳茱萸鹼、熱 (>43°C)、氫離子和發炎物質等。近年來,許多證據都顯示瞬時受體電位香草酸第一亞型通道在血管內皮細胞中也會表現,且與血管舒張的調控有關,然而,其是否參與在粥狀動脈硬化的形成及可能扮演的角色和機制

至今尚未十分清楚。我們的研究報告指出,若給予內皮細胞瞬時受體電位香草酸第一亞型通道的配體辣椒素或是吳茱萸鹼,都可以有效的提高內皮細胞一氧化氮生成酶上絲胺酸635和1179的磷酸化程度,並且加強了瞬時受體電位香草酸第一亞型通道和內皮細胞一氧化氮生成酶間的交互作用,最後使得一氧化碳的生成量增加,而若同時利用瞬時受體電位香草酸第一亞型通道的拮抗劑則可以有效的阻斷此一連串的作用。此外,給予瞬時受體電位香草酸第一亞型通道的配體可增強蛋白激酶B、鈣/鈣調蛋白依赖性蛋白激酶II、磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶和瞬時受體電位香草酸第一亞型通道本身磷酸化現象,並增加瞬時受體電位香草酸第一亞型通道與上述蛋白激酶結合的情

況。若同時給予細胞外鈣離子螯合劑則可以有效的抑制此一連串的現象。在野生型小鼠中,利用吳茱萸鹼活化瞬時受體電位香草酸第一亞型通道可以增加主動脈中蛋白激酶B、鈣/鈣調蛋白依赖性蛋白激酶II、磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶和內皮細胞一氧化氮生成酶磷酸化以及血管新生的現象,然而此結果在瞬時受體電位香草酸第一亞型通道剔除小鼠中則觀察不到。此外,吳茱萸鹼透過增加蛋白質磷酸酶2B活性進而作用於蛋白激酶C上來達到降低內皮細胞一氧化氮生成酶上抑制性位點蘇胺酸497的磷酸化程度。在高血脂模式載脂蛋白E剔除小鼠的病變處發現瞬時受體電位香草酸第一亞型通道的蛋白量有明顯的提升,且主要表現於巨噬細胞。給予巨噬細胞氧化態低密度脂

蛋白可觀察到瞬時受體電位香草酸第一亞型通道有活化及表現量增加的現象。而由氧化態低密度脂蛋白引發的泡沫細胞形成及由腫瘤壞死因子?悕狺獉_的第一型單核球趨化因子和介白素第六因子的生成也會因給予瞬時受體電位香草精第一亞型通道的配體而受到抑制,相反的若給予其拮抗劑則會增強這些反應。然而,給予巨噬細胞瞬時受體電位香草酸第一亞型通道的配體卻不會影響到A型清道夫受體、B型清道夫受體 (CD36)和第一類B型清道夫受體的表現,且並不會影響到細胞與螢光標定的氧化態低密度脂蛋白間的結合,相反的,此配體的給予卻會增加細胞內膽固醇的輸出及三磷酸腺苷結合盒轉運體A1和G1的表現。在活體中也可以觀察到,與載脂蛋白E基因剔

除鼠相比,載脂蛋白E/瞬時受體電位香草酸第一亞型通道雙基因剔除鼠的病灶、血脂、發炎反應和肝臟脂質堆積的情形都有更為惡化的現象。而以管餵的方式給予載脂蛋白E基因剔除鼠吳茱萸鹼,則不僅可以有效的增加肝臟內負責清除膽固醇的三種蛋白三磷酸腺苷結合盒轉運體G5、G8和膽固醇羥化酶7A1的表現,更可以抑制粥狀動脈硬化的病徵,然而,此作用在載脂蛋白E/瞬時受體電位香草酸第一亞型通道雙基因剔除鼠卻無法觀察到。總結來說,我們的研究不僅顯示瞬時受體電位香草酸第一亞型通道在粥狀動脈硬化中扮演了保護性的角色,更證實了其機制是透過增加內皮細胞一氧化氮生成酶的活性和抑制了泡沫細胞的形成。