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利用16S rRNA 基因序列調查圈養海豚腸道細菌相

為了解決kw v3缺點的問題，作者董家齊 這樣論述：

在腸道共生菌對哺乳動物健康的相互關係中，我們已知其協助動物各種生理運作包括消化、免疫及維生素合成等重要性。相關的研究已在人類的基礎研究中，對於不同族群、年齡、性別、懷孕等不同的分組上建立大量的參考資料；在各種保育動物中前人對於圈養或野生的水生哺乳動物如江豚、海豚、鬚鯨、海獅等動物進行調查。但到目前為止，在台灣仍未對圈養海豚進行類似調查。傳統細菌的研究仰賴大量的培養與鑑定，但無法克服困難培養菌種與生化性狀表現混淆分類及不能對菌種比例進行全面統計等缺失，直到利用次世代定序 (Next Generation Sequencing，NGS) 技術才一一排除上述缺點。本次論文採用 NGS 針對檢體中細

菌 16S rRNA gene 中 V1 - V3 保守區設計引子，探討於單一圈養水域中的海豚，在人工控制的環境變因下，其糞便細菌組成的變化與海豚種別、性別、採樣月份、懷孕與否及個體因素下的關聯性。而初步的結果顯示，在上述的五種分組條件下，圈養海豚糞便細菌相的組成除了個體因素外沒有顯著差異；然在個體出現消化道疾病或因服用藥物後糞便細菌相的組成受到改變。此次研究亦是首次對於懷孕海豚糞便菌相的調查，也將國內獸醫學在海豚疾病的研究上向前推進，促進海豚保育研究。